热点问题

情况：我公司与一家机票代理商A签订了机票预订业务，并约定机票预订以及发票开具方、收款方均为该代理商A；现因为一些国际机票配置号限制的问题，代理商A会委托其关联公司代理商B一起给我公司提供国际机票的预订，在国际机票客票行程单上会显示销货单位为A或者B，但是我们统一付款给A，包括手续费均由A开具发票。

请问：这种国际机票销货单位为两家情况，我们能否统一付款给A，会涉及到增值税专用发票的三流不合一情况吗？