热点问题

公司主营业务是免所得税及增值税的.
公司原来销售产品是按照出厂价销售不问客户收取运费。现在公司从成本角度考虑，决定要将运输发生的成本也让客户承担。所以决定将来按照到厂价格进行销售。 当然如果客户愿意自己派车来提货的，我们依旧用出厂价格销售。
我们计划新的销售合同提供2个价格，即出厂价和到厂价。看发货时客户如何决定是自提还是让我们公司安排。
我们的问题是，对于按照 到厂价 进行销售的情况，发票如何开具，发票主体内容这里还是有品名，数量，单价，金额等， 备注里是否能标注“到厂价”的字眼，因为有些客户要求发票上要注明是到厂价，这样他们内部可以知道为什么价格高了。
那对我们公司来说，这样开具发票是否有风险，税务局是否会认定我们的销售不能免税，因为包含运费了？
除此之外，请问老师有其他好的建议吗？ 非常感谢！